Tak jest, problem (bug) jest powtarzalny. Wystarczy odebrać email, popup wyskakuje, wyłączamy szybciorem plugin, a następnie klikamy dla pewności na popupie który w dalszym ciągu jest widoczny.
Też tak przypuszczałem, że API jest jedno, więc raczej jest to wina WTW. Podczas wyłączania pluginu powinno się zwalniać pamięć i wyłączać wszystkie stworzone przez niego okna. A widocznie tak nie jest.